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肺癌是世界上最常見的惡性腫瘤之一。基因突變是非小細胞肺癌發生發展和轉移的重要因素。KRAS突變是非小細胞肺癌中最主要的基因突變之一,近年來針對KRAS G12C抑制劑的開發取得了突破性進展,但是針對KRAS其它突變如KRAS G12D等仍缺乏有效的靶點藥物。
近日,蘭州大學公共衛生學院教授石磊團隊在《細胞死亡與分化》發表研究成果,揭示了lncRNA HIF1A-As2與MYC形成雙向調控環路,促進KRAS G12D誘導的非小細胞肺癌發生發展和轉移,為研究lncRNA在腫瘤中的作用機制提供新的思路,為非小細胞肺癌的診斷和治療提供新的靶點,具有重要的理論意義和醫學價值。
通過RNA-seq,團隊發現KRAS調控的80條lncRNA中,HIF1A-As2上調幅度最大。通過TCGA(The Cancer Genome Atlas)數據分析,發現HIF1A-As2在肺癌組織表達明顯高于正常組織,并且與細胞增殖和腫瘤發生息息相關。近來,有文獻報道HIF1A-As2可以促進在非小細胞肺癌耐藥性和腫瘤發生發展。但是在已發表論文中,HIF1A-As2主要作為microRNA海綿分子參與腫瘤發生發展,在其它層面的分子機制仍不清楚,尤其在非小細胞肺癌中的生物學功能和分子調控機理也有待闡釋。
通過RAP-MS(RNA Antisense Purification Mass Spectrometry)和CLIP(Cross-linking RNA Immunoprecipitation)實驗,課題組初步篩選出HIF1A-As2結合蛋白質DHX9。DHX9,又名RHA(RNA Helicase A),主要參與DNA復制、轉錄調控、RNA運輸和microRNA生物合成等多項生物學功能。通過RNA-seq、RT-qPCR等方法,課題組發現HIF1A-As2不調控鄰近基因(順式調控),主要調控遠端基因,揭示了其反式調控基因表達的功能。通過GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)和GO(Gene Ontology)功能分析,課題組發現HIF1A-As2參與轉錄調控,與MYC通路密切相關。課題組進一步發現,HIF1A-As2通過招募DHX9到MYC啟動子,從而激活MYC轉錄調控,影響下游基因表達,促進細胞增殖和轉移。此外,MYC可以結合在HIF1A-As2區域,從而轉錄后激活HIF1A-As2的表達水平。綜上,HIF1A-As2和MYC形成雙向反饋環路,促進腫瘤發生發展。
最后通過PDX動物模型,課題組發現HIF1A-As2 antisense oligonucleotide(ASO)聯合MYC小分子抑制劑,可以有效抑制腫瘤增長;通過KRASLSLG12D誘導小鼠模型,HIF1A-As2 ASO可以增強機體對Cisplatin的敏感性,抑制腫瘤轉移。